*偷偷告訴你:文末有驚喜?。?!
PTM全稱Post-translationalmodification,即翻譯后修飾,是蛋白質(zhì)生物合成過程的較后步驟。PTM之于蛋白質(zhì),有點像PS之于照片,經(jīng)過PTM的蛋白質(zhì)會有不同的樣子和功能。
今天給大家介紹一款很厲害的試劑盒,能夠準(zhǔn)確高效的提取并富集不同的PTM,方便您的后續(xù)研究~
蛋白質(zhì)是生命活動的主要承擔(dān)者,蛋白質(zhì)層面的研究,最常被關(guān)注的就是蛋白表達(dá)量的改變。然而,蛋白表達(dá)量高低的調(diào)控形式過于單一,難以滿足生物體如此復(fù)雜的運行要求。
那么如何解決這個問題呢?別急,大自然早就為蛋白質(zhì)加好了buff~ 這個buff就是PTM, 蛋白質(zhì)的翻譯后修飾。
蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(Proteinpost-translational modification, PTM)是一項重要的技能,是指在蛋白質(zhì)的氨基酸側(cè)鏈上共價結(jié)合化學(xué)小分子基團(tuán),例如我們最了解的磷酸化修飾:
據(jù)估計,哺乳動物含有數(shù)百萬種獨特的蛋白質(zhì)組但其卻源于一個相對簡單的基因組(約25000個基因),蛋白質(zhì)組的復(fù)雜程度和蛋白質(zhì)功能的多樣性都要歸功于PTM。
目前已知的PTM的種類超過400種,幾乎所有的蛋白質(zhì)均可發(fā)生PTM。并且,同一個蛋白質(zhì)還可同時具有多種PTM。蛋白發(fā)生PTM后,會顯著改變其理化性質(zhì)和構(gòu)象,從而直接改變蛋白的結(jié)合能力與功能。因此,即使蛋白本身的表達(dá)水平?jīng)]有改變,但如果翻譯后修飾的狀態(tài)發(fā)生改變,蛋白的功能也會顯著變化。
在PTM這個超級buff的加持下,蛋白質(zhì)的種類和功能都得到了指數(shù)級擴(kuò)增。
下圖以中間絲蛋白(IF)為例,描述了針對于IF的各種不同PTM對于其蛋白功能的影響:
盡管目前已知的PTM的種類超過400種,但只有少數(shù)幾個被詳細(xì)研究過,主要包括甲基化、磷酸化、乙酰化、泛素化和SUMO化,它們被證明是幾乎所有細(xì)胞的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因素,包括信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、表觀遺傳學(xué)、基因和蛋白質(zhì)表達(dá)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和定位以及細(xì)胞免疫。
目前主要研究的PTM及其作用和特點
PTM類別 |
已發(fā)表作用 |
新發(fā)現(xiàn)作用 |
目標(biāo)氨基酸 |
修飾物 |
甲基化 |
表觀調(diào)節(jié) |
蛋白質(zhì)互作,信號轉(zhuǎn)導(dǎo) |
R, K |
甲基轉(zhuǎn)移酶, 去甲基化酶 |
磷酸化 |
信號轉(zhuǎn)導(dǎo) |
蛋白質(zhì)互作,表觀調(diào)節(jié) |
Y, S, T |
激酶,磷酸酶 |
乙酰化 |
表觀和代謝調(diào)節(jié) |
蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、定位、合成 |
K |
乙酰化酶, 去乙?;?/span> |
泛素化 |
蛋白酶體靶向-降解 |
蛋白質(zhì)定位,蛋白質(zhì)互作 |
K |
泛素連接酶, 去泛素化酶 |
SUMO化 |
核蛋白定位,轉(zhuǎn)錄活性 |
蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、應(yīng)激反應(yīng)、細(xì)胞周期 |
K |
SAE, ubc9, SENP |
蛋白修飾及功能的多樣性是維持機(jī)體復(fù)雜精準(zhǔn)調(diào)控的基礎(chǔ),但同時也給研究PTM的科研人員的研究造成了很多的困擾。
為什么蛋白質(zhì)翻譯后修飾的鑒定難度要遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于未發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)的鑒定,主要有以下幾點原因:
發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質(zhì)樣本量相對較少;
發(fā)生修飾時形成的共價鍵非常不穩(wěn)定,且處于動態(tài)變化中 ;
修飾與未修飾的蛋白及多種修飾形式的蛋白常混合存在 。
針對這些困擾,Cytoskeleton公司開發(fā)了一系列名為 Signal-Seeker? 的試劑盒,用于研究各種蛋白翻譯后修飾。
Signal-Seeker? 試劑盒使用親和磁珠從任何給定的細(xì)胞或組織裂解液中提取并富集修飾蛋白,然后通過標(biāo)準(zhǔn)的Western blot程序分析濃縮蛋白群,最終用戶使用自身的抗體檢測所需的修飾蛋白。
Signal-Seeker?試劑盒檢測流程如下圖
Signal-Seeker?試劑盒的特點和優(yōu)勢
Signal-Seeker?試劑盒配套相應(yīng)的抗體,能對任意蛋白的轉(zhuǎn)錄后修飾進(jìn)行研究;
Signal-Seeker?試劑盒提供通用的裂解過濾系統(tǒng)及定量工具,能輕松從給定的細(xì)胞或組織裂解液中提取蛋白并進(jìn)行總蛋白的定量;
Signal-Seeker?親和磁珠,富集效果無與倫比,配合對照磁珠,提供PTM蛋白精準(zhǔn)定量;
Signal-Seeker?親和磁珠可用于捕獲PTM修飾的蛋白,然后用于進(jìn)行進(jìn)一步的分析(如Westernblot和質(zhì)譜檢測);
關(guān)鍵的去修飾化抑制劑,防止檢測過程中的去修飾;
Signal-Seeker?kit可以用于研究多重PTM的串?dāng)_(例如目標(biāo)蛋白的泛素化和乙?;?;
市面上最全面的PTM試劑盒:包括通用裂解過濾系統(tǒng)、蛋白質(zhì)定量工具、IP濃縮試劑、洗滌試劑、洗脫試劑、化學(xué)發(fā)光試劑。
Signal-Seeker?試劑盒應(yīng)用實例
Signal-Seeker?試劑盒研究Rac1蛋白的單泛素化和多元泛素化
用MG-132預(yù)處理Swiss 3T3 細(xì)胞,然后添加/不添加CNF1 (cat# CN04)處理3h,用BK161 kit來進(jìn)行 IP,裂解液上樣量300 μg /次。
Lane 1: 3 μg 未處理的裂解液;
Lane 2: Ubiquitin親和磁珠(cat# UBA01) +未處理的裂解液;
Lane 3: UBA01 + CN04處理的裂解液;
Lane 4: Ubiquitin 對照磁珠(cat# CUB02) +未處理的裂解液;
Lane 5: CUB02 + CN04處理的裂解液.
*注:用細(xì)菌毒素CNF1(cat#CN04)處理細(xì)胞會導(dǎo)致Rac1的組成性激活,并隨后導(dǎo)致單泛素化和多泛素化。
可以看到,未經(jīng)修飾的Rac1與泛素親和珠和泛素對照珠(lane 2-5)發(fā)生非特異性相互作用;然而,單泛素化和多泛素化Rac1僅與泛素親和珠(lane 3)結(jié)合,而與泛素對照珠(lane 5)不結(jié)合。所以建議用戶在實驗時使用適當(dāng)?shù)膶φ罩閬韼椭鷧^(qū)分未修飾的目標(biāo)蛋白帶。
為了幫助大家更好的抓住PTM并且研究它們,現(xiàn)在Cytoskeleton公司對以下PTM研究相關(guān)產(chǎn)品進(jìn)行促銷:
即日起至2019.6.30,
購買以下任意產(chǎn)品均可享受7折優(yōu)惠,
不要錯過哦~
此次促銷產(chǎn)品清單如下
Signal-Seeker?試劑盒
BK160 |
Signal-Seeker? Phosphotyrosine Enrichment Kit |
KIT 30 assays |
BK160-S |
Signal-Seeker? Phosphotyrosine Enrichment Kit |
KIT 10 assays |
BK161 |
Signal-Seeker? Ubiquitin Enrichment Kit |
KIT 30 assays |
BK161-S |
Signal-Seeker? Ubiquitin Enrichment Kit |
KIT 10 assays |
BK162 |
Signal-Seeker? SUMOylation Enrichment Kit |
KIT 30 assays |
BK162-S |
Signal-Seeker? SUMOylation Enrichment Kit |
KIT 10 assays |
BK163 |
Signal-Seeker? Acetyl-Lysine Enrichment Kit |
KIT 30 assays |
BK163-S |
Signal-Seeker? Acetyl-Lysine Enrichment Kit |
KIT 10 assays |
BK165 |
Signal-Seeker? SUMOylation-1 Enrichment Kit |
KIT 30 assays |
BK165-S |
Signal-Seeker? SUMOylation-1 Enrichment Kit |
KIT 10 assays |
乙?;贵w
AAC01 |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody (3C6.08.20) |
2 x 100 μl |
AAC01-S |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody (3C6.08.20) |
1 x 25 μl |
AAC02 |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody (7B5A1) |
2 x 100 μl |
AAC02-S |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody (7B5A1) |
1 x 25 ul |
AAC03 |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody (19C4B2.1) |
2 x 100 μl |
AAC03-S |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody (19C4B2.1) |
1 x 25 ul |
AAC03-HRP |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody HRP Conjugates |
1 x 100 μl |
AAC03-HRP-S |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody HRP Conjugates |
1 x 25 ul |
AAC04-beads |
Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody Agarose Conjugates |
4 x 500 μl |
AACX1 |
Chemically Acetylated Bovine Serum Albumin (BSA) |
1 x 500 μg |
磷酸化抗體
APY03 |
Anti-Phosphotyrosine Mouse Monoclonal Antibody |
2 x 100 μl |
APY03-Beads |
Anti-Phosphotyrosine Affinity Beads |
4 x 300 μl |
APY03-HRP |
Anti-Phosphotyrosine-HRP Mouse Monoclonal Antibody |
1 x 100 μl |
APY03-HRP-S |
Anti-Phosphotyrosine-HRP Mouse Monoclonal Antibody (Trial Size) |
1 x 25 μl |
APY03-HRP-XL |
Anti-Phosphotyrosine-HRP Mouse Monoclonal Antibody |
Large Quantities |
APY03-S |
Anti-Phosphotyrosine Mouse Monoclonal Antibody (Trial Size) |
1 x 25 μl |
SUMO化抗體
ASM01 |
Anti-SUMO-1 Mouse Monoclonal Antibody |
1 x 100 μl |
ASM01-S |
Anti-SUMO-1 Mouse Monoclonal Antibody (Trial Size) |
1 x 25 μl |
ASM11-Beads |
SUMOylation-1 Affinity Beads |
3 x 400 μl |
ASM23 |
Anti-SUMO-2/3 Mouse Monoclonal Antibody |
2 x 100 μl |
ASM23-HRP-S |
Anti-SUMO-2/3-HRP labeled Mouse Monoclonal Antibody (Clone 12F3) |
1 x 25 μl |
ASM23-HRP |
Anti-SUMO-2/3-HRP labeled Mouse Monoclonal Antibody (Clone 12F3) |
1 x 100 μl |
ASM23-S |
Anti-SUMO-2/3 Mouse Monoclonal Antibody (Trial Size) |
1 x 25 μl |
ASM24 |
Anti-SUMO-2/3 Mouse Monoclonal Antibody |
2 x 200 μl |
ASM24-Beads |
SUMO-2/3 Affinity Beads |
2 x 400 μl |
ASM24-S |
Anti-SUMO-2/3 Mouse Monoclonal Antibody (Trial Size) |
1 x 150 μl |
泛素化抗體
AUB01 |
Anti-Ubiquitin Mouse Monoclonal Antibody |
2 x 100 μl |
AUB01-HRP |
Anti-Ubiquitin-HRP Antibody |
1 x 100 μl |
AUB01-HRP-S |
Anti-Ubiquitin-HRP Antibody |
1 x 25 μl |
AUB01-S |
Anti-Ubiquitin Mouse Monoclonal Antibody (Trial size) |
1 x 25 μl |
AUB01-XL |
Anti-Ubiquitin Mouse Monoclonal Antibody |
4 x 500 μl |
其他相關(guān)試劑
BLR01 |
BlastR Rapid Lysate Prep Kit |
50 purifications |
BLR02 |
BlastR Rapid Filtration Kit |
50 purifications |
CIG01-beads |
Control for Immunoprecipitation IgG beads |
10 assays |
CIG02-beads |
Control for Acetylation Immunoprecipitation IgG beads |
10 assays |
CIG03-beads |
Control for SUM01 Immunoprecipitation IgG beads |
10 assays |
CUB02-beads |
Control for Ubiquitin Affinity Beads |
10 assays |
UBA01-beads |
Ubiquitin Affinity Beads |
40 rxs |