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嘿!PTM ! 我抓住你啦!

作者:admin信息來源:達(dá)科為日期:2019年05月22日打印字體:  
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*偷偷告訴你:文末有驚喜?。?!

PTM全稱Post-translationalmodification,即翻譯后修飾,是蛋白質(zhì)生物合成過程的較后步驟。PTM之于蛋白質(zhì),有點像PS之于照片,經(jīng)過PTM的蛋白質(zhì)會有不同的樣子和功能。

今天給大家介紹一款很厲害的試劑盒,能夠準(zhǔn)確高效的提取并富集不同的PTM,方便您的后續(xù)研究~

蛋白質(zhì)是生命活動的主要承擔(dān)者,蛋白質(zhì)層面的研究,最常被關(guān)注的就是蛋白表達(dá)量的改變。然而,蛋白表達(dá)量高低的調(diào)控形式過于單一,難以滿足生物體如此復(fù)雜的運行要求。

那么如何解決這個問題呢?別急,大自然早就為蛋白質(zhì)加好了buff~ 這個buff就是PTM, 蛋白質(zhì)的翻譯后修飾。

蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(Proteinpost-translational modification, PTM)是一項重要的技能,是指在蛋白質(zhì)的氨基酸側(cè)鏈上共價結(jié)合化學(xué)小分子基團(tuán),例如我們最了解的磷酸化修飾:

據(jù)估計,哺乳動物含有數(shù)百萬種獨特的蛋白質(zhì)組但其卻源于一個相對簡單的基因組(約25000個基因),蛋白質(zhì)組的復(fù)雜程度和蛋白質(zhì)功能的多樣性都要歸功于PTM。

目前已知的PTM的種類超過400種,幾乎所有的蛋白質(zhì)均可發(fā)生PTM。并且,同一個蛋白質(zhì)還可同時具有多種PTM。蛋白發(fā)生PTM后,會顯著改變其理化性質(zhì)和構(gòu)象,從而直接改變蛋白的結(jié)合能力與功能。因此,即使蛋白本身的表達(dá)水平?jīng)]有改變,但如果翻譯后修飾的狀態(tài)發(fā)生改變,蛋白的功能也會顯著變化。

PTM這個超級buff的加持下,蛋白質(zhì)的種類和功能都得到了指數(shù)級擴(kuò)增。

下圖以中間絲蛋白(IF)為例,描述了針對于IF的各種不同PTM對于其蛋白功能的影響:

盡管目前已知的PTM的種類超過400,但只有少數(shù)幾個被詳細(xì)研究過,主要包括甲基化、磷酸化、乙酰化、泛素化和SUMO化,它們被證明是幾乎所有細(xì)胞的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因素,包括信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、表觀遺傳學(xué)、基因和蛋白質(zhì)表達(dá)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和定位以及細(xì)胞免疫。

目前主要研究的PTM及其作用和特點

PTM類別

已發(fā)表作用

新發(fā)現(xiàn)作用

目標(biāo)氨基酸

修飾物

甲基化

表觀調(diào)節(jié)

蛋白質(zhì)互作,信號轉(zhuǎn)導(dǎo)

R, K

甲基轉(zhuǎn)移酶,

去甲基化酶

磷酸化

信號轉(zhuǎn)導(dǎo)

蛋白質(zhì)互作,表觀調(diào)節(jié)

Y,  S, T

激酶,磷酸酶

乙酰化

表觀和代謝調(diào)節(jié)

蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、定位、合成

K

乙酰化酶,

去乙?;?/span>

泛素化

蛋白酶體靶向-降解

蛋白質(zhì)定位,蛋白質(zhì)互作

K

泛素連接酶,    

去泛素化酶

SUMO

核蛋白定位,轉(zhuǎn)錄活性

蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、應(yīng)激反應(yīng)、細(xì)胞周期

K

SAE,  ubc9, SENP

蛋白修飾及功能的多樣性是維持機(jī)體復(fù)雜精準(zhǔn)調(diào)控的基礎(chǔ),但同時也給研究PTM的科研人員的研究造成了很多的困擾。

為什么蛋白質(zhì)翻譯后修飾的鑒定難度要遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于未發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)的鑒定,主要有以下幾點原因:

  • 發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質(zhì)樣本量相對較少;

  • 發(fā)生修飾時形成的共價鍵非常不穩(wěn)定,且處于動態(tài)變化中 ;

  • 修飾與未修飾的蛋白及多種修飾形式的蛋白常混合存在 。

針對這些困擾,Cytoskeleton公司開發(fā)了一系列名為 Signal-Seeker? 的試劑盒,用于研究各種蛋白翻譯后修飾。

Signal-Seeker? 試劑盒使用親和磁珠從任何給定的細(xì)胞或組織裂解液中提取并富集修飾蛋白,然后通過標(biāo)準(zhǔn)的Western blot程序分析濃縮蛋白群,最終用戶使用自身的抗體檢測所需的修飾蛋白。

Signal-Seeker?試劑盒檢測流程如下圖

Signal-Seeker?試劑盒的特點和優(yōu)勢

  • Signal-Seeker?試劑盒配套相應(yīng)的抗體,能對任意蛋白的轉(zhuǎn)錄后修飾進(jìn)行研究;

  • Signal-Seeker?試劑盒提供通用的裂解過濾系統(tǒng)及定量工具,能輕松從給定的細(xì)胞或組織裂解液中提取蛋白并進(jìn)行總蛋白的定量; 

  • Signal-Seeker?親和磁珠,富集效果無與倫比,配合對照磁珠,提供PTM蛋白精準(zhǔn)定量;

  • Signal-Seeker?親和磁珠可用于捕獲PTM修飾的蛋白,然后用于進(jìn)行進(jìn)一步的分析(如Westernblot和質(zhì)譜檢測); 

  • 關(guān)鍵的去修飾化抑制劑,防止檢測過程中的去修飾;

  • Signal-Seeker?kit可以用于研究多重PTM的串?dāng)_(例如目標(biāo)蛋白的泛素化和乙?;?;

  • 市面上最全面的PTM試劑盒:包括通用裂解過濾系統(tǒng)、蛋白質(zhì)定量工具、IP濃縮試劑、洗滌試劑、洗脫試劑、化學(xué)發(fā)光試劑。 

Signal-Seeker?試劑盒應(yīng)用實例

Signal-Seeker?試劑盒研究Rac1蛋白的單泛素化多元泛素化

用MG-132預(yù)處理Swiss 3T3 細(xì)胞,然后添加/不添加CNF1 (cat# CN04)處理3h,用BK161 kit來進(jìn)行 IP,裂解液上樣量300 μg /次。

Lane 1: 3 μg 未處理的裂解液;

Lane 2: Ubiquitin親和磁珠(cat# UBA01) +未處理的裂解液;

Lane 3: UBA01 + CN04處理的裂解液;

Lane 4: Ubiquitin 對照磁珠(cat# CUB02) +未處理的裂解液;

Lane 5: CUB02 + CN04處理的裂解液.

*注:用細(xì)菌毒素CNF1(cat#CN04)處理細(xì)胞會導(dǎo)致Rac1的組成性激活,并隨后導(dǎo)致單泛素化和多泛素化。

可以看到,未經(jīng)修飾的Rac1與泛素親和珠和泛素對照珠(lane 2-5)發(fā)生非特異性相互作用;然而,單泛素化和多泛素化Rac1僅與泛素親和珠(lane 3)結(jié)合,而與泛素對照珠(lane 5)不結(jié)合。所以建議用戶在實驗時使用適當(dāng)?shù)膶φ罩閬韼椭鷧^(qū)分未修飾的目標(biāo)蛋白帶。


為了幫助大家更好的抓住PTM并且研究它們,現(xiàn)在Cytoskeleton公司對以下PTM研究相關(guān)產(chǎn)品進(jìn)行促銷:

即日起至2019.6.30

購買以下任意產(chǎn)品均可享受7折優(yōu)惠,

不要錯過哦~

此次促銷產(chǎn)品清單如下

Signal-Seeker?試劑盒

BK160

Signal-Seeker? Phosphotyrosine  Enrichment Kit

KIT 30 assays

BK160-S

Signal-Seeker?  Phosphotyrosine Enrichment Kit

KIT 10 assays

BK161

Signal-Seeker? Ubiquitin  Enrichment Kit

KIT 30 assays

BK161-S

Signal-Seeker? Ubiquitin  Enrichment Kit

KIT 10 assays

BK162

Signal-Seeker? SUMOylation  Enrichment Kit

KIT 30 assays

BK162-S

Signal-Seeker? SUMOylation  Enrichment Kit

KIT 10 assays

BK163

Signal-Seeker?  Acetyl-Lysine Enrichment Kit

KIT 30  assays

BK163-S

Signal-Seeker? Acetyl-Lysine  Enrichment Kit

KIT 10 assays

BK165

Signal-Seeker?  SUMOylation-1 Enrichment Kit

KIT 30  assays

BK165-S

Signal-Seeker? SUMOylation-1  Enrichment Kit

KIT 10 assays

乙?;贵w

AAC01

Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal  Antibody (3C6.08.20)

2 x 100 μl

AAC01-S

Anti-Acetyl  Lysine Mouse Monoclonal Antibody (3C6.08.20)

1 x 25 μl

AAC02

Anti-Acetyl Lysine Mouse  Monoclonal Antibody  (7B5A1)   

2 x 100 μl

AAC02-S

Anti-Acetyl  Lysine Mouse Monoclonal Antibody  (7B5A1)   

1 x 25 ul

AAC03

Anti-Acetyl Lysine Mouse  Monoclonal Antibody (19C4B2.1)

2 x 100 μl

AAC03-S

Anti-Acetyl Lysine Mouse Monoclonal Antibody  (19C4B2.1)

1 x 25 ul

AAC03-HRP

Anti-Acetyl  Lysine Mouse Monoclonal Antibody HRP Conjugates

1 x 100 μl

AAC03-HRP-S

Anti-Acetyl Lysine Mouse  Monoclonal Antibody HRP Conjugates

1 x 25 ul

AAC04-beads

Anti-Acetyl Lysine Mouse  Monoclonal Antibody Agarose Conjugates

4 x 500 μl

AACX1

Chemically  Acetylated Bovine Serum Albumin (BSA)

1 x 500 μg

磷酸化抗體

APY03

Anti-Phosphotyrosine Mouse  Monoclonal Antibody

2 x 100 μl

APY03-Beads

Anti-Phosphotyrosine  Affinity Beads

4 x 300 μl

APY03-HRP

Anti-Phosphotyrosine-HRP  Mouse Monoclonal Antibody

1 x 100 μl

APY03-HRP-S

Anti-Phosphotyrosine-HRP  Mouse Monoclonal Antibody (Trial Size)

1 x 25 μl

APY03-HRP-XL

Anti-Phosphotyrosine-HRP  Mouse Monoclonal Antibody

Large Quantities

APY03-S

Anti-Phosphotyrosine Mouse  Monoclonal Antibody (Trial Size)

1 x 25 μl

SUMO化抗體

ASM01

Anti-SUMO-1 Mouse Monoclonal  Antibody

1 x 100 μl

ASM01-S

Anti-SUMO-1  Mouse Monoclonal Antibody (Trial Size)

1 x 25 μl

ASM11-Beads

SUMOylation-1 Affinity Beads

3 x 400 μl

ASM23

Anti-SUMO-2/3 Mouse  Monoclonal Antibody

2 x 100 μl

ASM23-HRP-S

Anti-SUMO-2/3-HRP labeled  Mouse Monoclonal Antibody (Clone 12F3)

1 x 25 μl

ASM23-HRP

Anti-SUMO-2/3-HRP labeled  Mouse Monoclonal Antibody (Clone 12F3)

1 x 100 μl

ASM23-S

Anti-SUMO-2/3 Mouse  Monoclonal Antibody (Trial Size)

1 x 25 μl

ASM24

Anti-SUMO-2/3 Mouse  Monoclonal Antibody

2 x 200 μl

ASM24-Beads

SUMO-2/3 Affinity Beads

2 x 400 μl

ASM24-S

Anti-SUMO-2/3 Mouse  Monoclonal Antibody (Trial Size)

1 x 150 μl

泛素化抗體

AUB01

Anti-Ubiquitin Mouse  Monoclonal Antibody

2 x 100 μl

AUB01-HRP

Anti-Ubiquitin-HRP  Antibody

1 x 100 μl

AUB01-HRP-S

Anti-Ubiquitin-HRP Antibody

1 x 25 μl

AUB01-S

Anti-Ubiquitin Mouse  Monoclonal Antibody (Trial size)

1 x 25 μl

AUB01-XL

Anti-Ubiquitin Mouse  Monoclonal Antibody

4 x 500 μl

其他相關(guān)試劑

BLR01

BlastR  Rapid Lysate Prep Kit

50  purifications

BLR02

BlastR Rapid Filtration Kit

50 purifications

CIG01-beads

Control for  Immunoprecipitation IgG beads

10 assays

CIG02-beads

Control for Acetylation  Immunoprecipitation IgG beads

10 assays

CIG03-beads

Control for  SUM01 Immunoprecipitation IgG beads

10 assays

CUB02-beads

Control for Ubiquitin  Affinity Beads

10 assays

UBA01-beads

Ubiquitin  Affinity Beads

40 rxs

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