Denovo的微信推文已經(jīng)陪伴大家走過了7期的內(nèi)容,想必大家已經(jīng)被Denovo強(qiáng)大的流式數(shù)據(jù)分析功能徹底圈粉了吧!前面7期的內(nèi)容主要介紹了Denovo軟件的安裝,流式數(shù)據(jù)分析的入門篇,流式數(shù)據(jù)的批量處理,多色分析及流式凋亡數(shù)據(jù)分析。那么本期內(nèi)容更厲害了呢!在本期內(nèi)容中小達(dá)君將給大家奉上細(xì)胞周期的流式數(shù)據(jù)分析的相關(guān)內(nèi)容。趕快打開電腦,搬好小板凳,和小達(dá)君一起開始實(shí)戰(zhàn)演習(xí)吧~
? 演示工具:裝有Denovo FCS Express 6的電腦一臺(tái)(參考入門篇的試用裝版本安裝~)
? 演示數(shù)據(jù):細(xì)胞周期的流式數(shù)據(jù)分析
? 演示內(nèi)容:細(xì)胞周期數(shù)據(jù)的分析,關(guān)于細(xì)胞周期各個(gè)參數(shù)的調(diào)用,統(tǒng)計(jì)學(xué)圖表的建立
1.添加實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)
參考前面推文可知,在Denovo軟件中添加數(shù)據(jù)的方式有多種,以下通過Data list命令按鈕直接添加,具體操作如下:
2.數(shù)據(jù)分析
將數(shù)據(jù)添加進(jìn)來之后,圈門,把目的細(xì)胞拖拽出來,單獨(dú)分析,首先需要去除粘連細(xì)胞,不同的流式細(xì)胞儀排除粘連細(xì)胞時(shí),用到的參數(shù)有時(shí)候不一樣,此處,通過改變PI通道的參數(shù)(分別改成FL2-A及FL2-W)來去除粘連細(xì)胞,具體操作如下圖:
3.細(xì)胞周期的流式數(shù)據(jù)分析模板建立
a.粘連細(xì)胞去除之后,可直接調(diào)用Denovo自帶的細(xì)胞周期分析模板,完成數(shù)據(jù)分析,具體操作如下:
b.將細(xì)胞周期分析的模板調(diào)出來之后,點(diǎn)擊OK,會(huì)彈出如下圖所示的界面,然后可以利用insert按鈕,插入文本框,從而可實(shí)現(xiàn)圖注的編輯,如下圖所示(我們可以對(duì)圖中的每個(gè)峰進(jìn)行命名,從而可以對(duì)細(xì)胞周期中的各個(gè)時(shí)期進(jìn)行命名和解釋):
4.細(xì)胞周期的流式數(shù)據(jù)分析中相關(guān)參數(shù)的調(diào)用
a.在細(xì)胞周期分析的模板中,有不同的模板可以調(diào)用,用戶可以根據(jù)自己的需要,選擇相應(yīng)的細(xì)胞周期數(shù)據(jù)分析模型,具體操作如下圖所示:
b.不同的細(xì)胞周期數(shù)據(jù)分析模型,其分析標(biāo)準(zhǔn)不一樣,Denovo對(duì)不同的模型均作了相關(guān)的定義,用戶可以直接查看,具體操作如下:
c.當(dāng)完成細(xì)胞周期數(shù)據(jù)分析后,接上面一步,可以通過Statistics按鈕,將相關(guān)的參數(shù)調(diào)出來,具體展示如下:
5.利用Spreadsheets插入圖表
(參考Part7的微信推文,里面有詳細(xì)的關(guān)于Spreadsheets的使用)
a.舉例,對(duì)細(xì)胞周期中G1期,S期及G2期各細(xì)胞比列的情況分析并做成柱形圖及餅狀圖,直接插入Spreadsheets,然后將相應(yīng)的數(shù)據(jù)拖拽入表格中,點(diǎn)擊insert命令按鈕,插入相應(yīng)的柱形圖和餅狀圖,操作如下:
b.同時(shí)通過Format按鈕可以更改圖形的相關(guān)參數(shù),可以使圖表的排版及色彩布置達(dá)到令用戶滿意的效果,如下圖所示:(具體操作可參見part7-凋亡數(shù)據(jù)分析的中關(guān)于插入圖表的介紹)
由于微信的演示空間有限,本期的內(nèi)容介紹就到此結(jié)束,Denovo FCS Express 6還有更多,更好,更強(qiáng)的流式數(shù)據(jù)分析功能,我們期待和您共同探討,感興趣的可以在下方留言并留下您的聯(lián)系方式,我們技術(shù)部的同事會(huì)和您聯(lián)系~